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Sendo o subsolo rico deste material, há muitas grutas e cavernas com rochas calcárias, apresentando muitas formações, os chamados espeleotemas:
estalagtites, estalagnites, elegtites e cones. Além de tudo isso, a maioria das grutas são alagadas, têm no seu interior lagos com águas transparentes, variando de cores entre o azul e verde esmeralda pelo efeito do carbonato de cálcio diluido nas águas. Esse conjunto mágico faz com que as Grutas, Cavernas, Rios e Cachoeiras de Bonito sejam de uma beleza indescritível, somente ao vivo para crer. A imagem a seguir é da caverna do Abismo Anhumas com incidência de raio de Sol refletindo na água do lago, onde se praticam a flutuação e o mergulho autônomo (scuba dive).